无论是常规养殖鱼类或名特优以及无鳞鱼等，都是靠鳃部过滤水体中的DO进行呼吸，而鳃则是鱼类的呼吸器官，鱼类通过鳃丝上的细微鳃小片进行过滤DO来维持生命活动能力。从呼吸器官的排列来讲，鳃呼吸占据最大比例达到70%，然后是皮肤呼吸占到20%~25%，接下来是咽喉呼吸、肠道呼吸、鳔呼吸各占约3%，最后是假鳃占2%左右，从这些器官呼吸分布所占的比例，我们可分析得出呼吸器官可分为主要呼吸器官（即鳃）和辅助呼吸器官（皮肤、咽喉、肠道等）当主呼吸器官出现一些明显的异常问题或受到其他因素影响时才会启用辅助器官。
鱼类的发病原因有多种可致使本身的鳃部出现问题（如烂鳃、寄生虫、肠炎、鳃托泥、水环境、亚盐偏高等）都是主体问题，当然也避免不了有些继发性引起的疾病对鳃丝造成的伤害，都会直接影响鱼类的鳃丝过滤及呼吸。
鱼类鳃呼吸和皮肤呼吸无直接关系，当鳃部受到如烂鳃、寄生虫感染、有害藻类过多、水体杂质过多、水体理化因子超标等损害时，都会应影响鱼类呼吸和摄氧量，在鱼类生存所需的溶解氧一定的情况下，鳃呼吸摄入的DO达不到生命所需值时，则会同时启用自身的皮肤进行呼吸，来满足鳃呼吸DO的不足，以达到生存所需总量。
在养殖过程中，如上述所讲（烂鳃、寄生虫等）因素，都会直接影响鱼类鳃呼吸，影响率达到20%~30%左右，而这中间的差距则首先由皮肤呼吸系统第一进行供给，那么皮肤进行呼吸的频率则加快，将会达到40%~50%而在供给的过程中，由于水体中细菌致病微生物大量存在和对皮肤的侵袭，首先破坏机体的免疫系统??粘液层，在粘液层破坏后机体首先就丧失了对细菌等致病微生物的抵抗作用，继而细菌等附着在受破坏的皮肤表层进行大量繁殖，并消耗附着面的营养，形成病灶，病灶受多重细菌致病生物的感染，再发展成为溃烂、烂皮、烂身等疾病。
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